一直以来，皇太极的目标是夺取大明天下。但他也深知，明军虽然屡次败于后金军，国力的确在日渐削弱。然而，大明毕竟在中原地区绵延了数百年，根基还算牢固，并不是轻易就能够战胜的。努尔哈赤去世以后，袁崇焕特地派使者前去沈阳吊丧，或许他是真心想去探望努尔哈赤，也或许只是为了打探后金的实际情况。此时的皇太极心里自然很不是滋味儿，一向不肯认输的他，居然好几次都败在袁崇焕手里，他对袁崇焕窝了一肚子的怨恨。但因为顾忌到后金军刚打完败仗，还需要一段时日休整；同时，他也想试探一下明朝的态度。所以，皇太极热情接待了袁崇焕的使者。此后，他还亲自派使者到宁远去表示后金的答谢之意。从表面上看来，他们的关系似乎缓和下来了，实际上并没有那么简单。

明熹宗时期，也就是朱由校执政期间，大宦官魏忠贤权倾一时，还自封为“九千岁”，对当时的时政影响颇大。魏忠贤嫉功妒贤，向来看不惯袁崇焕。当时的袁崇焕，即便多次打了胜仗，但还是一度受到魏忠贤的排挤。后来，袁崇焕知道魏忠贤有心跟他为难，只好主动提出辞职，准备回老家养老。直到崇祯帝朱由检即位之后，袁崇焕才再次被起用。因为崇祯帝早就了解魏忠贤作恶多端、飞扬跋扈、民愤太大，所以即位没多久，就立即宣布了魏忠贤的种种罪状，并把魏忠贤充军到凤阳。魏忠贤自己知道翻身无望，在路途中畏罪自杀了。

崇祯帝在惩办了阉党魏忠贤的同时，又平反了杨涟、左光斗等人的冤狱，当时的他一心只想做个好皇帝，很想有一番大作为。之后，朝中许多大臣纷纷上奏，请求把袁崇焕召回朝廷。崇祯帝接受了大臣们的提议，提拔袁崇焕为兵部尚书，并让他负责指挥整个河北、辽东的军事。为了考验这位众臣推荐的袁崇焕，崇祯帝特意召他入宫，并询问他日后有什么计划。袁崇焕说：“只要给我指挥权，朝廷各部一致配合，不出五年，可以恢复辽东。”崇祯帝听后十分满意，觉得袁崇焕是一个有勇有谋之士，于是赏赐他一把尚方宝剑，准许他全权行事。

就这样，袁崇焕再次回到了宁远，并开始选拔将才，重新整顿队伍。但是，当时东江总兵毛文龙对袁崇焕很是不服，总是跟袁崇焕唱反调，不服从指挥，袁崇焕说往西，他偏偏往东。这个毛文龙，到底是什么人呢？原来他在与后金的战争中立有战功，但是他为人骄恣、独断辛辣，让袁崇焕很是头疼，劝说再三，他依然不肯听从袁崇焕的命令。无奈之下，袁崇焕只得使用尚方宝剑，斩杀了毛文龙。毛文龙被杀后，皇太极脑子里顿时产生了一个大胆而冒险的念头：避开宁锦防线，绕道内蒙古，突袭京师，来个调虎离山，将袁崇焕“调”到京师，并将其除掉。

天聪三年(1629年)十月，也就是毛文龙被杀后的三个多月，皇太极亲自率领十万大军绕道进关，准备突袭京城。这次出征，皇太极让熟悉道路的蒙古喀喇沁部台吉布尔葛做向导。在他的带领下，清军浩浩荡荡开出沈阳，并向西北行军，路经都尔鼻(今辽宁彰武)，后来进入今内蒙古科尔沁地，最后到达青城，随后便安营扎寨。这时候，大贝勒代善、三贝勒莽古尔泰等人都不太同意深入大明境内。他们认为，劳师袭远，处境实在太危险，建议皇太极立即班师，另找机会进攻，也为时不晚。就因为这件事，他们争论到半夜，还是没能定下来。皇太极心中很是不悦，他只对诸贝勒说了一句话：“我谋既隳，又何待为？”“密谕之曰：‘我已定策……’”其实皇太极说的“定策”，就是利用这一迂回进攻，借机除掉袁崇焕，以解他心头之恨。

这一次，后金军突然袭击京城，引起了全城上下很大的震动。崇祯帝得知后金军向京城进发的消息后，更是心慌意乱，一时间不知道怎么办。于是立即下令，让袁崇焕速速赶来救驾。很快，袁崇焕八百里加急，只身一人先赶到了京城，他的军队随后赶到。崇祯帝得知袁崇焕赶来，心里这才安定了一些。随后，崇祯帝还亲自召见了袁崇焕，并慰劳了一番。但是，就在这关键时刻，魏忠贤的余党却散布了这样一则谣言：这次后金军绕道袭击京城，完全是袁崇焕引进来的，说不定里面还有什么大阴谋呢。

崇祯帝是一个疑心很重的人，当他听到这些谣言后，即便他知道魏忠贤余党的话不可信，但心中还是有一些疑问。他回想了下袁崇焕的种种举止，并不断告诉自己，这是不可能的。但是他想得越多，心里的疑虑就越大。正在崇祯帝疑虑重重之际，有一个被后金军俘虏去的杨太监从后金军营逃了回来，随后，急匆匆地向崇祯帝密告，说袁崇焕和皇太极早已经私下里订下了密约，商量好要一起进攻京城。当崇祯帝听到这个消息后，如同晴天霹雳，整个人都不好了，简直接近崩溃了。

原来事情是这样发生的，当时明军有两个太监，不幸被后金军俘虏一直关在军营。有天傍晚，杨太监正睡得香，却突然被门外两个人的谈话吵醒了，他听见两个看守他们的后金兵在聊一些事情。只听一个士兵说：“今天咱们临阵退兵，完全是皇上（指皇太极）的意思，你知道吗？”另一个士兵说：“你是怎么知道的？”一个士兵又说：“刚才我就看到皇上一个人骑着马，向明营的方向走了。巧的是，明营也正好有两个人骑马过来，跟皇上说了好半天话才回去的。听说那两人是袁崇焕袁将军派来的，他早就跟皇上有密约，眼看大事就要成功啦………”杨太监听到这番话，瞬间没了睡意。他趁看守他的金兵不注意，偷偷跑了出来，一口气逃回了明宫，并立即向崇祯帝报告。崇祯帝听后，居然也信以为真，发誓一定要好好惩治袁崇焕。他哪里知道，这个情报完全是假的，这两个金兵的谈话也是皇太极特意安排的，那个杨太监也是皇太极故意放走的。

此时的崇祯帝，崩溃的心情稍稍平复了一些，他立即命令袁崇焕前来觐见。袁崇焕接到命令后，预感到事情不妙，但也具体不知道发生了什么事。因为他从宫中回来没多久，为什么又要急匆匆召他入宫呢？崇祯帝看到袁崇焕后，满脸不悦，大声呵斥他说：“袁崇焕，你为什么要擅自杀死我军大将毛文龙？为什么金军已经到了京城，而你的援兵却还迟迟没到，只有你自己赶到了京城？”袁崇焕听完这番话，不禁怔了一下，对于崇祯帝的这些话，他真的不知道从何说起？他正想答辩，崇祯帝却不给他任何机会，早已经喝令锦衣卫把袁崇焕捆绑起来，押进了大牢里。

当时，有一位大臣和袁崇焕交往甚好，他知道袁崇焕平日里忠心为国，不可能做出这样的事情，觉得这件事情肯定有蹊跷，于是前去劝阻崇祯帝：“请陛下慎重考虑啊！”崇祯帝说：“什么慎重不慎重？慎重只会误事。”很显然，崇祯帝不愿意听任何大臣的劝告。那些魏忠贤的余党自然不怕事大，又趁机诬陷，这让崇祯帝更加确信了袁崇焕跟皇太极是早有密谋的。

半年以后，崇祯帝便将袁崇焕判处最残酷的磔刑，就是俗话说的千刀万剐，死得极惨。据说在袁崇焕被行刑后，许多人都争食其肉，以泄心中之愤。袁崇焕被处死后，他的家产也都被没收入官，他的兄弟、妻子都统统被流放三千里。在当时和其后很长一段时间里，人们一直都认定：袁崇焕资敌通敌，背叛大明，死有余辜。直到大清朝入关后，人们在修撰清太宗皇太极的实录时，真相才大白于天下，袁崇焕的冤死才得以昭雪。

这一次，踔厉风发的皇太极，巧妙使用反间计，并借崇祯帝之手，顺利铲除了他的对手袁崇焕，然后退兵回到沈阳。后来，再联系到袁崇焕斩杀毛文龙，这一套纵横捭阖可称为“连环计”。看得出来，皇太极在军事和政治方面都出类拔萃，的确是个不可多得的人才。自那以后，大清王朝开始变得越来越强盛了。