军工部的成立是朱由检早就思量好了的，不过眼下这事还急不得，得等人员到齐以后再展开后续工作也不迟。
朱由检看到，王承恩随工部尚书薛凤翔去办里组建军工部，所涉及的人员资料还没有回来，就招呼值守内官：“去传曹化淳来见朕。”
值守内官赶紧领命而去。
现在的朱由检内心里还惦记着三个人（为什么总是三个！）呢，并且就如何任用他们感到很是纠结。
第一个人物，就是那个上一世那个被自己问策时，放大招说出惊天地泣鬼神“五年可以平辽”的袁崇焕袁大督师了。
朱由检认为：上一世的自己由最初登上帝位时的豪气万丈，到后来在“己巳之变”中，被皇太极狠狠地一记左勾拳打的颜面全无，自那一刻起导致了自己性情大变，再也不敢信任、放权与领兵将领的结果，应该与袁崇焕的种种所为有关。
最初，朱由检自己对袁大督师可以说是信任又加，并且赋予了极大的权利，尽帝国之可能的予以大力支持，可是……。在己巳之变中，虽说是中了皇太极实施反间计，把刚刚解了京城之围的袁崇焕下狱，最终将后金鞑掳感到头疼的的这个劲敌，以通敌谋逆的罪名凌迟处死。对于处决袁崇焕这件事，朱由检至死都没有后悔过，反倒是对草率干掉九千岁魏忠贤这事心生悔意，可见朱由检大帝对袁崇焕恨意有多深了，致使袁崇焕的兄弟妻子也受牵连被流放三千里，籍其家。
不过，袁崇焕也确实算得上是个忠臣，绝不是奸细，这朱由检还是相信的。袁崇焕无子，家亦无余赀，可以说他不是贪官，也没有克扣军饷、吃空饷，而且他还花自己的饷银与士卒，就这一点说他勾结后金，那倒是是受了天下奇冤。
不说其他，就单纯的评价袁崇焕擅杀毛文龙一事，朱由检是非常愤怒的，这也是导致袁崇焕获罪的一大导火索。
当初，毛文龙的存在，使的努尔哈赤及皇太极非常顾忌。袁崇焕“连败”努尔哈赤父子的二次进攻，主要靠红衣大炮的防守；而毛文龙则是主动出击，连有斩获。这不是说袁崇焕这样打不对，所处的环境不同，实施的战略当然也有不同，只是说，毛文龙的“游击战”对后金所造成的困扰之大。当年，袁崇焕在宁远一战中，毛文龙充分发挥了在敌人的大后方的骚扰、牵制作用。毛文龙在当时，有海外长城之誉。
有人说，袁崇焕擅杀毛文龙，无疑为皇太极进伐明朝搬掉了一头拦路虎，同时还为皇太极送去了“三支冲锋枪”。这一点，朱由检很是赞同，此话一点也没有夸张。
哪三支冲锋枪？是这哥仨：恭顺王孔有德、怀顺王耿仲明、智顺王尚可喜，史称“三顺王”。三顺王，顾名思义，归顺之意。《清史稿》说：有德、仲明，毛文龙部曲；可喜，东江偏将……太宗抚有德等，恩纪周至，终收绩效……推诚以得人，节善以励众，其诸为兴王之度也欤！
看到了吧，为满清立下汗马功劳的他们及被封为续顺公的沈志祥，原来都是毛文龙的部下。汗颜得很啊。
当初，袁大督师杀了毛文龙后，对毛文龙的部下说不搞牵连：“诛止文龙，余无罪。”毛文龙麾下健校悍卒数万，忌惮袁虎威，不敢作乱，但是心下却埋下了仇恨的种子，此事一直没有得到有效的平息。他们这些人身受毛文龙的知遇之恩，也都知到故主毛文龙的为人。而袁大督师安排副将陈继盛统辖东江镇所部，但是，陈继盛威望不足、能力有限啊，处事还有所不公，从而引发严重的内讧。
孔有德不愿同陈继盛共事，于是同耿仲明率部投登莱巡抚孙元化了。后来，孔有德又自称都元帅，铸印登坛，设置官员，袭扰明军，造反了。为什么造反，这个倒成了迷，现在的孔有德为什么到了孙元化手下后再造反？朱由检估么着，应该是孙的手下也有排挤之意，加上孔有德已经有了判出东江镇的前科，所以心理障碍也不大“此处不留爷，自有留爷处”。
皇太极闻讯后，立即派人去拉拢，招抚孔、耿到盛京。他们可是带着孙元化呕心沥血打造的一只“现代化”的、装备精良的热兵器的军事力量，还把那些能够打造这些先进的火枪、火炮热兵器熟练的工匠一同绑架到后金去的。得到消息的皇太极简直是有种天降金元宝砸晕的感觉，简直是老天有眼、天降祥瑞、喜从天降啊。当孔有德他们率领一众叛军到达时后金时，皇太极纾尊降贵，亲至都门迎接，行抱见礼，把盏敬酒，封孔有德为都招讨印，命其军为天祐军。不久又招来了尚可喜和沈志祥。自此，后金也拥有了攻城略地的火炮等利器了，大明的倚仗就此失去。古史称孔有德为明末叛将之“首恶”也就一点不为过了。
这些人，在毛文龙手下，不过中级军官，而被清太宗拔高尊崇，封王封公。他们感恩戴德地甘为攻城略地的走狗鹰犬，为新主不辞辛劳、殚精竭力地灭故国。但他们的下场没一个好的，特别是首恶孔有德更是遭报应血脉断绝。
倘若袁崇焕不矫杀毛文龙，而是真诚地帮助毛文龙改变旧习、整肃军纪，孔有德诸人也许（只是也许）有另一番历史功业。《清史稿》说：文龙不死，诸人者非明边将之良欤？
第二个人物，就是现在正效力于辽东，时任辽东车右营都司的左良玉了。
左良玉是在辽东成长起来的，在对后金的作战中非常勇敢：
崇祯三年（1630年），因宁远卫兵变而丢官近两年的左良玉得以复职，左良玉被总理马世龙派遣跟随游击将军曹文诏，转战玉田、丰润，与清军在洪桥、大堑山、遵化等地。战后与曹文诏获得增秩的赏赐，隶昌平督治侍郎侯恂麾下。
崇祯四年（1631年）七月，因先前高第尽撤宁锦防线，右屯、大凌河等城被毁，孙承宗派人对其进行重新修筑，为破坏筑城，清军突然来攻。总兵官尤世威因护守皇陵不能去，就推荐左良玉代他率兵前往。过后，侯恂推举他做了副将，带队在松山、杏山下与后金作战，功劳排在第一位。
可见，前期的左良玉还是很有战力的，且非常勇猛。
左良玉发家于镇压农民军，在崇祯十年以前，左良玉在对农民军的作战中还是发挥了极大的作用，也多有斩获。但是自崇祯十一年起，此人就开始拥兵自重、飞扬跋扈、专横跋扈。时常不听调令配合剿匪，还经常纵兵在当地掳掠妇女、财物，简直是罄竹难书、比禽兽还不如。
这第三位就是，以孔有德这个首恶叛将为代表的江东镇，毛文龙手下这四员大将：孔有德、耿仲明、尚可喜、沈志祥。
可以说，若不是他们的叛逃，使得大明失去了辛苦编练出来的新型的火器部队。造成的结果就是，在对后金的作战中是越来越被动。况且后金有了这先进的火炮、火枪，还有工匠连续不断的制造供应，也不怕消耗。再加有上即能操练、又能指挥火器部队作战的这几个叛将的参与，在后金其后对明军的作战中，本来就依仗火器才得以坚守的明军岂有不败之理。
至于海外的郑芝龙父子，现在的朱由检倒不怎么担心。朱由检还是相信历史事件会重演的：崇祯元年（1628年），熊文灿就职福建巡抚，郑芝龙由厦门攻铜山，文灿招降芝龙，任命为海防游击。所以啊，这事不急，现在也顾不上，等郑芝龙被召降了再说吧。
还有那个吴三桂，现在还没崭露头脚，至于将来用不用再说吧。反正朱由检在位期间，吴三桂镇守的山海关没有被后金攻破过。
朱由检下定决心，当下这些人还是可用之才，只不过还是要坚强监督和压制的，不能过早的让他们有独掌大权的机会，免得以后缺乏约束力后膨胀的无法驾驭了。
“皇上，曹公公求见。”值守内官禀报。
“奥？让他进来吧。”在大殿门口站的有些累的朱由检转身回到屋内。
曹化淳得到许可后，快步走进英武殿：“微臣参见皇上，不知皇上召见臣有何吩咐？”他是一个内敛的人，在皇上面前一直比较正式。
朱由检看了曹化淳一眼：“嗯，你来的倒是挺及时的，朕准备给分派你两个任务。”
曹化淳忙做出聆听状。
“第一件事就是，你要在咱这后宫大内，对所有的宫女太监进行仔仔细细的审查，把魏忠贤的人、哪怕是不确定的人都要给朕剔除出来，不可有遗留，宁可冤枉十人，不可漏掉一个！要保密，甄别好了后把名单交给王承恩即可，朕有用。”朱由检坐在龙椅上，右手搓着高档黄花梨制成的龙椅扶手，一字一顿的吩咐着。
“这第二件事吗就是，把你东厂所有的幡子都收回来，与皇宫中的所有的太监、宫女们整合在一起。年龄较长的吗这个就以40岁为限，以上的留在宫内，分配到各个岗位上去任职，不过这宫内职位要进行精简，不必要的就裁撤掉；40岁以下的包括40岁的全都编练进你东厂，今后你东厂最主要的任务就是，要对这些人进行统一的编练。至于东厂以前的职责就全部取消，朕会赋予你东厂新的职责。就这样，记着！要尽快把这些符合条件的，40及40以下年龄的人组织起来。组织好后，先进行简单的军事基础操练，等操练的差不多了你就来向朕禀报一下，朕呢还有吩咐！”朱由检语气深长的说着，好像对此事非常重视。
曹化淳表示一一记下了。
